En comparación con un escaneo rápido, un escaneo profundo es una función de recuperación de datos que rastrea la unidad de destino en busca de fragmentos de archivos accesibles en función de la información que tiene el software sobre cómo debería verse la firma del archivo y luego los combina. Un escaneo profundo es más exitoso para archivos grandes debido a cómo el sistema de archivos distribuye los fragmentos de archivo a través del medio de almacenamiento.
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